La Fundación Muhammad Subuh (MSF) honra el nombre de Bapak Muhammad Subuh Sumohadiwidjojo. Es la fundación que comparte, junto con la Asociación Mundial Subud, el apoyo a la visión de Bapak de ser una fuerza activa y beneficiosa para toda la humanidad. El propósito de la Fundación Muhammad Subuh es construir un fondo de capital para sostener su visión. Este fondo de capital mantiene e invierte los activos de Subud recibidos a través de donaciones y legados de miembros y empresas.

El crecimiento de la Fundación se basa en los legados y herencias dejados por los miembros Subud de todo el mundo a través de dotaciones, regalos, fideicomisos y testamentos. La MSF no realiza recaudaciones de fondos; sin embargo, las donaciones de los miembros siempre son bienvenidas.